通常是由于gnome和KDE下字体分辨率不同，导致两个环境下同一字号字体实际显示大小不同。解决的方法很多，可以调整字号也可以调整字体分辨率。个人认为还是调整字体分辨率更彻底些，尽管改变字号得到的效果也是一样的。
gnome和KDE的字体分辨率
一般gnome使用的字体分辨率为96dpi，可以通过gnome-font-properties中的“细节”来查看和修改。
KDE的字体分辨率由XF86Config-4文件Monitor段的DisplaySize来配置。如果没有特别给出，则系统自动侦测。在KDE中使用xdpyinfo | grep dot，可以得到当前的字体分辨率，一般为75dpi.一个96，一个75，导致了同一字号的字体显示出来的大小不同。
调整方法
一种方法可以在gnome-font-properties中将96dpi修改为75dpi，详见上面的第一个链接。不过需要在KDE启动时运行gnome-settings-daemon才能生效。
我用的是另一种方法：修改DisplaySize来将KDE的字体分辨率调整为96dpi.这种方法简单一些，只要在XF86Config-4的Monitor段加入：DisplaySize .和具体的显示器有关，如果手头没有参数，可能要算一算。
上面第二个链接中给出了1600x1200的LCD，两个值为423和317时，字体分辨率为96dpi.那么我的15寸LCD，分辨率为1024x768时，要得到96dpi的字体分辨率，可以按比例计算两个值为271和203.计算误差可能会使得这样实际结果为95x96dpi.改为270和203就可以了。
目前为止，我观察了常用的几个程序，字体都是正常的。