Mahout源码分析:并行化FP

FP-Growth是一种常被用来进行关联分析,挖掘频繁项的算法。与Aprior算法相比,FP-Growth算法采用前缀树的形式来表征数据,减少了扫描事务数据库的次数,通过递归地生成条件FP-tree来挖掘频繁项。参考资料[1]详细分析了这一过程。事实上,面对大数据量时,FP-Growth算法生成的FP-tree非常大,无法放入内存,挖掘到的频繁项也可能有指数多个。本文将分析如何并行化FP-Growth算法以及Mahout中并行化FP-Growth算法的源码。

1. 并行化FP-Growth

  并行化FP-Growth的方法有很多,最早提出使用MapReduce并行化FP-Growth算法的应该是来自Google Beijing Research的Haoyuan Li等(见参考资料[2])。他们提出使用三次MapReduce来并行化FP-Growth,整个过程大致可以分为五个步骤:

Step 1:Sharding

  为了均衡整个集群的读写性能,将事务数据库分成若干个数据片段(shard),存储到P个节点中。

Step 2:Parallel Counting

  与WordCount类似,通过一次MapReduce来计算每一个项(item)的支持度。具体来说,每一个mapper将从hdfs中取得事务数据库的若干个数据片段(shards),所以mapper的输入是<key, value=Ti>,Ti表示数据片段中的一条数据。对于Ti中的每一个项aj,mapper输出<key=aj, value=1>。当集群中的所有mapper处理完数据之后,所有key=aj的键值对将被分配到同一个reducer,所以reducer的输入是<key=aj, value={1, 1, ... , 1}>。reducer只需要进行一次求和,然后输出<key=aj, value=sum{1, 1, ... , 1}>。最终将得到一张按照支持度递减排序的列表,称之为F-List:

Mahout源码分析:并行化FP

图1

Step 3:Grouping Items

  将F-List中的项(item)分为Q个组(group),每一个组都有一个唯一的group-id,我们将所有项以及其所对应的group-id记为G-List。

Step 4:Parallel FP-Growth

  这一步骤是并行化FP-Growth的关键,也是整个算法中相对难以理解的部分。这一步骤中将用到一次MapReduce。每一个mapper的输入来自第一步生成的数据片段,所以mapper的输入是<key, value=Ti>。在处理这些数据片段之前,mapper将读取第三步生成的G-List。G-List其实是一张Hashmap,键是项,值是项所对应的group-id,所占空间一般并不会很大,可以放入内存中。从Ti的最后一项开始向前扫描,或者说从右向左扫描,如果aL在G-List中对应的group-id是第一次被扫描,则输出{a0,a1,…,aL},否则不输出任何数据。以图1中所示的数据为例,假如支持度阈值为1,Q为3,那么将得到G-List:

Mahout源码分析:并行化FP

图2

  其中,第三列是group-id。假如mapper的输入是{牛奶,鸡蛋,面包,薯片},从最后一项开始扫描,输出<key=1,value={牛奶,鸡蛋,面包,薯片}>。之后的两项是面包和鸡蛋,其所对应的group-id和薯片相同,所以不输出任何数据。第一项是牛奶,其所对应的group-id未曾出现过,所以输出<key=2,value={牛奶}>。

  所有group-id相同的数据将被推送到同一个reducer,所以reducer的输入是<key=group-id,value={{ValueList1},{ValueList2},…,{ValueListN}}>。reducer在本地构建FP-tree,然后像传统的FP-Growth算法那样递归地构建条件FP-tree,并挖掘频繁模式。与传统的FP-Growth算法不一样的是,reducer并不直接输出所挖掘到的频繁模式,而是将其放入一个大小为K,根据支持度排序建立的大根堆,然后输出K个支持度较高的频繁模式:<key=item,reduce={包含该item的Top K Frequent Patterns}>。 

Step 5:Aggregating

  上一步挖掘到的频繁模式Top K Frequent Patterns已经包含了所有频繁模式,然而上一步的MapReduce是按照groupID来划分数据,因此key=item对应的频繁模式会存在于若干个不同groupID的reduce节点上。为了合并所有key=item的键值对,优化结果展现形式,可利用MapReduce默认对key排序的特点,对挖掘到的频繁模式进行一下处理:依次将Top K Frequent Patterns的每一个item作为key,然后输出包含该key的这一条Top K Frequent Patterns。所以,每一个mapper的输出是<key=item, value={该节点上的包含该item的频繁模式}>,reducer汇总所有mapper的输出结果,并输出最终的结果<key=item, value={包含该item的所有频繁模式}>。 

2. Parallel FP-Growth源码分析

  Mahout提供了一些机器学习领域经典算法的实现。Mahout0.9之后的版本已经移除了Parallel FP-Growth算法。本文将分析Mahout0.8中Parallel FP-Growth的源码。

Mahout源码分析:并行化FP

图3

FPGrowthDriver.Java

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